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Transcriptional Profiling of ESTs from the Biocontrol Fungus Perfil transcripcional de ESTs del hongo de control biológico

Resumen

Se aplicó un análisis comparativo a dos bibliotecas de cDNA/ESTs (C1 y C2) de . En total, se secuenciaron y ensamblaron 5538 ESTs en 2162 unigenes, que incluyen 585 contigs y 1577 singletons. El análisis BlastX permitió identificar 1211 unigenes con similitudes a secuencias en las bases de datos públicas. El transportador de monosacáridos MFS se encontró como el gen expresado en mayor nivel en la biblioteca C2, pero sin expresión en C1. La mayoría de los unigenes eran específicos de cada biblioteca. El análisis comparativo de los ESTs reveló además diferencias en la expresión génica y las vías metabólicas entre las bibliotecas. Se identificaron dos secuencias diferentes similares a la endoquitinasa de 48-KDa y la endoquitinasa de 46-KDa en las bibliotecas C1 y C2, respectivamente.

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