Resumen

La especie silvestre de Rubus R. coreanus, ampliamente distribuida en el suroeste de China, resulta muy prometedora como recurso genético para la cría. Una de sus propiedades más destacadas es su adaptación a temperaturas y humedad elevadas. Para facilitar su uso en programas de selección y mejora genética, hemos ensamblado de novo 179.738.287 lecturas de R. coreanus (125 pb de longitud) generadas por secuenciación de ARN de frutos en tres fases de desarrollo representativas. También utilizamos el borrador del genoma de R. occidentalis, recientemente publicado, para realizar un ensamblaje guiado por referencias. Inferimos una referencia final de 95.845 transcritos para R. coreanus. De estos recursos genéticos, 66.597 (69,5%) estaban anotados. Basándonos en estos resultados, llevamos a cabo un análisis exhaustivo de los genes expresados diferencialmente. La biosíntesis de flavonoides, la biosíntesis de fenilpropanoides, la transducción de señales de hormonas vegetales y las vías de biosíntesis de cutina, suberina y cera se enriquecieron significativamente a lo largo del proceso de maduración. Identificamos 23 transcritos implicados en la ruta de biosíntesis de flavonoides cuya expresión era perfectamente paralela a los cambios en los metabolitos. Además, identificamos 119 genes codificadores de proteínas con sitios de unión a nucleótidos y repeticiones ricas en leucina (NBS-LRR), implicados en la resistencia a patógenos, de los cuales 74 se encontraban en el dominio completamente conservado. Estos resultados proporcionan, por primera vez, información genética de todo el genoma para comprender la regulación del desarrollo de los frutos de R. coreanus. Tienen el potencial de ser utilizados en la mejora genética a través de enfoques genéticos funcionales en un futuro próximo.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:R. coreanus, transducción de señales de hormonas vegetales, especies silvestres de Rubus R. coreanus, vía de biosíntesis de flavonoides, enfoques genéticos funcionales, fases de desarrollo representativas, vías de biosíntesis de ceras, amplia información genética, genes, resultados
• Keywords:R. coreanus, plant hormone signal transduction, wild Rubus species R. coreanus, flavonoid biosynthesis pathway, functional genetic approaches, representative developmental stages, wax biosynthesis pathways, wide genetic information, genes, results