Los ARN pequeños (ARNs) reguladores eucarióticos desempeñan un papel importante en muchos procesos celulares fundamentales. Como tales, han surgido como biomarcadores útiles para enfermedades y estados de diferenciación celular. Los biomarcadores basados en ARNs superan a los biomarcadores tradicionales basados en ARN mensajeros al analizar menos dianas con mayor precisión y proporcionar una detección más temprana de estados patológicos. Por lo tanto, la elaboración de perfiles de expresión de los ARNes es fundamental para seguir avanzando en la comprensión de los procesos biológicos, así como en el diagnóstico y el tratamiento de las enfermedades. La secuenciación de alto rendimiento (HTS, por sus siglas en inglés) es un método muy eficaz tanto para el descubrimiento de ARNs como para la elaboración de perfiles de expresión. En este artículo se analizan las consideraciones generales de los métodos de perfilado HTS basados en ARNs, desde la preparación del ARN hasta la construcción de bibliotecas de secuenciación, con especial atención a las causas de los errores sistemáticos. Al examinar los pasos de manipulación enzimática del perfilado de expresión de ARNs, este artículo pretende desmitificar los enfoques actuales de perfilado de ARNs basados en HTS y ayudar a los investigadores en el diseño e interpretación informados de los experimentos de perfilado.
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