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Artículo

Genome-Wide Expression Profiles of Hemp (Cannabis sativa L.) in Response to Drought StressPerfiles de expresión de todo el genoma del cáñamo (Cannabis sativa L.) en respuesta al estrés por sequía

Resumen

La sequía es el principal factor ambiental que perjudica el crecimiento y el rendimiento del cáñamo. Con el fin de descifrar las respuestas moleculares del cáñamo al estrés por sequía, se estudiaron los cambios en el transcriptoma del cáñamo estresado por sequía (DS1 y DS2), en comparación con el cáñamo de control bien regado (CK1 y CK2), con la tecnología RNA-Seq. RNA-Seq generó 9,83, 11,30, 11,66 y 11,31 M de lecturas limpias en las bibliotecas CK1, CK2, DS1 y DS2, respectivamente. Se identificaron un total de 1292 genes expresados diferencialmente (DEGs), incluyendo 409 (31,66%) genes regulados al alza y 883 (68,34%) genes regulados a la baja. Los patrones de expresión de 12 genes seleccionados se validaron mediante qRT-PCR, y los resultados concordaron con el análisis de Illumina. Los análisis de Gene Ontology (GO) y KEGG iluminaron importantes procesos biológicos y vías particulares, que enriquecieron muchos genes candidatos como NAC, B3, peroxidasa, expansina e inositol oxigenasa que pueden desempeñar papeles importantes en la tolerancia del cáñamo a la sequía. Once vías KEGG fueron significativamente influenciadas, siendo la más influenciada la vía de transducción de señales de hormonas vegetales con 15 genes expresados diferencialmente. Un patrón de expresión similar de genes implicados en la vía del ácido abscísico (ABA) bajo sequía, y la inducción de ABA, sugirieron que el ABA es importante en la respuesta al estrés por sequía del cáñamo. Estos resultados proporcionan información útil sobre el mecanismo regulador del estrés por sequía en el cáñamo.

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Información del documento

  • Titulo:Genome-Wide Expression Profiles of Hemp (Cannabis sativa L.) in Response to Drought Stress
  • Autor:Chunsheng, Gao; Chaohua, Cheng; Lining, Zhao; Yongting, Yu; Qing, Tang; Pengfei, Xin; Touming, Liu; Zhun, Yan; Yuan, Guo; Gonggu, Zang
  • Tipo:Artículo
  • Año:2018
  • Idioma:Inglés
  • Editor:Hindawi
  • Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
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