Resumen

Los ARN no codificantes largos (lncARN) están emergiendo como un importante controlador que afecta al desarrollo, la señalización y la función de los tejidos metabólicos. Sin embargo, poco se sabe acerca de la función y el perfil de lncRNAs en la diferenciación osteoblástica en ratones. Aquí, analizamos los conjuntos de datos de secuenciación de ARN (ARN-Seq) obtenidos durante 18 días en intervalos de dos días a partir de células preosteoblásticas calvariales de ratón neonatal. En el curso de la diferenciación de los osteoblastos, 4058 mRNAs y 3948 lncRNAs se expresaron diferencialmente, y se agruparon en 12 clusters de acuerdo con el patrón de expresión mediante fuzzy c-means clustering. Mediante el análisis de redes de coexpresión génica ponderada, se identificaron 9 módulos relacionados con la etapa de diferenciación temprana (días 2-8) y 7 módulos relacionados con la etapa de diferenciación tardía (días 10-18). La ontología génica y el análisis de enriquecimiento de vías KEGG revelaron que los ARNm y los ARNnl regulados al alza en la etapa de diferenciación tardía están altamente asociados con la osteogénesis. También identificamos 72 mRNA y 89 lncRNAs como marcadores potenciales, incluyendo varios marcadores novedosos para la diferenciación y activación de osteoblastos. Nuestros hallazgos proporcionan un valioso recurso para el estudio de lncRNAs en ratones y mejoran nuestra comprensión de la biología de la diferenciación osteoblástica en ratones.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:etapa de diferenciación tardía, lncRNAs, días, diferenciación de osteoblastos, diferenciación osteoblástica, análisis de enriquecimiento de vías KEGG, análisis ponderado de redes de coexpresión génica, etapa de diferenciación temprana, desarrollo metabólico de tejidos, estudio de lncRNAs en ratones.
• Keywords:late differentiation stage, lncRNAs, days, osteoblast differentiation, osteoblastic differentiation, KEGG pathway enrichment analysis, weighted gene coexpression network analysis, early differentiation stage, metabolic tissue development, mouse lncRNA study