En la exploración del sistema hidrotermal de la Cuenca de Guaymas (GB) entre 27° 00′ 35′′ y 27° 00′ 50′′ N y 111° 24′ 15′′ y 111° 24′ 40′′ W en el Golfo de California, realizado en el R/V Atlantis y del DSRV/Alvin en octubre de 2008, se obtuvieron cuatro testigos de sedimentos superficiales para analizar pigmentos fotosintéticos en dos localizaciones con condiciones extremas contrastadas: Oil Town y Great Pagoda. Se identificaron nueve pigmentos: Clorofila-a, Feofitina-a, Feoforbida-a, Pirofeofitina-a (productos de degradación de la clorofila-a), β-caroteno, aloxantina, zeaxantina, diadinoxantina y prasinoxantina (carotenoides). La concentración máxima de pigmentos se registró en la Gran Pagoda (10.309 ng/g) y la mínima en la Ciudad del Aceite (918 ng/g). Se demuestra que los perfiles de pigmentos fotosintéticos en los sedimentos superficiales dependen de la heterogeneidad de las condiciones extremas de cada sitio causadas principalmente por la temperatura y los sustratos bacterianos. Así, se observaron diferencias significativas (p <0,05) en el perfil pigmentario de los cuatro testigos sedimentarios analizados. Sin embargo, no se han detectado diferencias estadísticas (p > 0,05) en la concentración de pigmentos. Concluimos que los pigmentos fotosintéticos contenidos en los sedimentos superficiales de los respiraderos hidrotermales de la Cuenca de Guaymas son principalmente de origen bacteriano quimioautotrófico.
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