El virus VIH es uno de los más estudiados del mundo. Esto es especialmente cierto en términos de secuenciación de genes, y hasta la fecha se han secuenciado y analizado más de 9.000 secuencias genómicas de aislados del VIH. En este estudio se analiza una serie de secuencias de ADN que tienen el potencial de formar estructuras G-cuadruplex. Se encontraron varias secuencias de este tipo en diversos dominios codificantes y no codificantes del virus, incluidas las regiones U3 LTR, tat, rev, env y vpx. Curiosamente, en la cadena negativa se identificó una secuencia homológica al ya conocido aptámero de la integrasa del VIH. Las secuencias derivadas de los aislados originales se analizaron mediante métodos espectrales y electroforéticos estándar. Además, se aplica una metodología desarrollada recientemente que utiliza perfiles espectrales de dicroísmo circular inducido de complejos G-cuadruplex-ligando (naranja de tiazol) para determinar si las secuencias ricas en G pueden adoptar la estructura G-cuadruplex. Dirigirse a los cuadruplex G o a los dominios peptídicos correspondientes a la secuencia codificadora rica en G del VIH ofrece a los investigadores atractivas dianas terapéuticas que serían de especial utilidad en el desarrollo de nuevas terapias antivirales. El análisis de las regiones ricas en G puede proporcionar a los investigadores una vía para encontrar dianas específicas que podrían ser de interés para tipos concretos de virus.
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