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Artículo

Prediction of circRNA-miRNA Associations Based on Network EmbeddingPredicción de Asociaciones circRNA-miRNA Basada en Incrustación de Redes

Resumen

El circRNA es una nueva clase de ARN no codificante con estructura de bucle cerrado. Experimentos biológicos cada vez más numerosos han demostrado que los circRNAs desempeñan un papel importante en muchas enfermedades al actuar como una esponja de miARN para regular indirectamente la expresión de los genes diana de miARN. Por lo tanto, predecir las asociaciones entre circRNAs y miARNs puede promover la comprensión de la patogénesis de la enfermedad. En este artículo, proponemos un nuevo método computacional, NECMA, basado en el embebido de redes para predecir asociaciones potenciales entre circRNAs y miARNs. En nuestro método, las similitudes del kernel de perfil de interacción gaussiana (GIP) de circRNA y miARN se calculan en función de las asociaciones circRNA-miARN conocidas, respectivamente. Luego, la red de asociación circRNA-miARN, la red de similitud de kernel GIP de circRNA y la red de similitud de kernel GIP de miARN se utilizan para construir la

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