Resumen

Los complejos de proteínas desempeñan un papel crítico en la comprensión de los procesos biológicos y las funciones de los mecanismos celulares. La mayoría de los algoritmos existentes de detección de complejos de proteínas no pueden reflejar la dinámica de los complejos de proteínas. En este artículo, se propone un nuevo algoritmo llamado algoritmo de Agrupamiento de Búsqueda del Cucú Mejorado (ICSC) para detectar complejos de proteínas en redes de interacción proteína-proteína (PPI) dinámicas y ponderadas. Primero, construimos redes PPI dinámicas ponderadas y detectamos núcleos de complejos de proteínas en cada subred dinámica. Luego, se utilizó el algoritmo ICSC para agrupar los enlaces de proteínas a los núcleos. Los resultados experimentales tanto en el conjunto de datos DIP como en el conjunto de datos de Krogan demostraron que el algoritmo ICSC es más efectivo en la identificación de complejos de prote

• Materias:Simulación dinámica Toma de decisiones Regresión lineal Cargas controladas Seguridad multimedia
• Subjects:Dynamic simulation Decision making Linear regression Controlled loads Multimedia safety
• Palabras claves:Complejos de proteínas; Procesos biológicos; Mecanismos celulares; Algoritmo de agrupamiento de búsqueda de cuclillo mejorado; Redes de interacción de proteínas dinámicas ponderadas; Uniones de proteínas
• Keywords:Protein complexes; Biological processes; Cellular mechanisms; Improved Cuckoo Search Clustering algorithm; Weighted dynamic PPI networks; Protein attachments