Resumen

Los métodos anteriores para predecir las interacciones proteína-proteína (IPP) se centraban principalmente en las IPP dentro de una sola especie, pero las IPP entre diferentes especies han surgido recientemente como un tema importante en algunas áreas como la infección viral. El objetivo principal de este estudio es predecir las IPP entre el virus y su huésped diana, que están implicadas en la infección viral. Hemos desarrollado un método general que predice las interacciones entre el virus y las proteínas del huésped utilizando los patrones de repetición y la composición de aminoácidos. En pruebas independientes del método con PPIs de nuevos virus y huéspedes, mostró un alto rendimiento comparable al mejor rendimiento de otros métodos para PPIs de un solo virus-huésped. En la comparación de nuestro método con otros utilizando los mismos conjuntos de datos, nuestro método superó a los demás. Los patrones de repetición y la composición de aminoácidos son características simples, pero potentes, para predecir las IPP virus-hospedador. El método desarrollado en este estudio ayudará a encontrar nuevas IPP virus-hospedador para las que se dispone de poca información.

• Materias:Señales orofaciales Clasificación del cáncer Terapia de exposición Resonancias magnéticas Medicina de precisión
• Subjects:Orofacial signals Cancer classification Exposure therapy Magnetic resonance imaging Precision medicine
• Palabras claves:IBP, IBP huésped, método, virus, aminoácidos, patrones de repetición, infección viral, composición, estudio, Métodos anteriores
• Keywords:PPIs, host PPIs, method, virus, amino acids, repeat patterns, viral infection, composition, study, Previous methods