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FWHT-RF: A Novel Computational Approach to Predict Plant Protein-Protein Interactions via an Ensemble Learning MethodFWHT-RF: Un nuevo enfoque computacional para predecir interacciones proteína-proteína en plantas a través de un método de aprendizaje de conjunto.

Resumen

Las interacciones proteína-proteína (PPIs) en las plantas son cruciales para entender los procesos biológicos. Aunque las técnicas de alto rendimiento han producido información valiosa para identificar PPIs en las plantas, suelen ser costosas, ineficientes y extremadamente lentas. Por lo tanto, hay una necesidad urgente de desarrollar nuevos métodos computacionales para predecir PPIs en las plantas. En este artículo, proponemos un enfoque novedoso para predecir PPIs en las plantas utilizando únicamente la información de las secuencias de proteínas. Específicamente, las secuencias de proteínas de las plantas se convierten primero en matrices de puntuación específicas de posición (PSSM); luego, se utiliza el algoritmo de transformación rápida de Walsh-Hadamard (FWHT) para extraer vectores de características de PSSM y obtener información evolutiva de las proteínas de las plantas. Por último, se entrena el clasificador de bosques de rotación (RF) para la predicción y se producen

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