Resumen

La oveja Kivircik es una importante oveja local turca por la calidad de su carne y la productividad de su leche. El objetivo de este estudio era analizar los perfiles de expresión génica de la oveja Kivircik en las fases prenatal y postnatal. Por lo tanto, se construyeron dos bibliotecas diferentes de ADNc, que se tomaron del mismo tejido de glándula mamaria de la oveja Kivircik en las etapas prenatal y postnatal. Se secuenciaron un total de 3072 colonias seleccionadas aleatoriamente de las dos bibliotecas para crear una colección de EST de oveja. Se utilizaron los programas informáticos Phred/Phrap para el análisis de las EST en bruto y las secuencias EST legibles se ensamblaron con el software CAP3. Las funciones putativas de todas las secuencias únicas y el análisis estadístico se determinaron con el software Geneious. Un total de 422 EST tienen más de un 80% de similitud con secuencias conocidas de otros organismos en el NCBI clasificadas por la base de datos Panther para la categoría Gene Ontology (GO). Al comparar los perfiles de expresión génica, observamos algunos genes putativos que pueden estar relacionados con el rendimiento reproductivo o desempeñar funciones importantes en la síntesis y secreción de leche. Se ha depositado un total de 2414 EST en la base de datos GenBank del NCBI (GW996847-GW999260). Los datos EST de este estudio han proporcionado una nueva fuente de información a los estudios del genoma funcional de la oveja.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:perfiles de expresión génica, oveja Kivircik, etapas postnatales, oveja turca local importante, mismo tejido de glándula mamaria de oveja Kivircik, base de datos GenBank del NCBI, programas informáticos Phrap, diferentes bibliotecas de ADNc, estudios genómicos funcionales, secuencias EST legibles
• Keywords:gene expression profiles, Kivircik sheep, postnatal stages, important local Turkish sheep, same Kivircik sheep mammary gland tissue, NCBI GenBank database, Phrap computer programs, different cDNA libraries, functional genome studies, readable EST sequences