Resumen

Un concepto emergente en la regulación transcripcional es que una clase de factores de transcripción (FT) truncados, denominados microproteínas (miP), participan en interacciones proteína-proteína con complejos de FT y proporcionan controles de retroalimentación. En la literatura se han descrito un puñado de ejemplos de miP, pero no está claro el alcance de su prevalencia. Aquí presentamos un algoritmo que predice miPs y sus TFs diana a partir de un genoma secuenciado. El algoritmo se denomina programa de predicción de miPs (miP3) y está implementado en Python. El programa ayudará a arrojar luz sobre la prevalencia, las funciones biológicas y la evolución de las miPs. Además, miP3 puede utilizarse para predecir otros tipos de proteínas similares a miP que pueden haber evolucionado a partir de otras clases funcionales, como quinasas y receptores. El programa es de libre acceso y puede aplicarse a cualquier genoma secuenciado.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:miPs, programa de predicción de miPs, otras clases funcionales, factores de transcripción truncados, algoritmo, miP3, prevalencia, complejos de TF, funciones biológicas, controles de retroalimentación
• Keywords:miPs, miP prediction program, other functional classes, truncated transcription factors, algorithm, miP3, prevalence, TF complexes, biological roles, feedback controls