Resumen

Se estudia la estructura de dúplex de cadena paralela G,T de ADN con cantidades similares de residuos de adenina y guanina mediante simulaciones de dinámica molecular (DM) y espectroscopias UV y CD. Además, se analiza el impacto de la sustitución de adenina por 8-aminoadenina y de guanina por 8-aminoguanina. La presencia de 8-aminoadenina y 8-aminoguanina estabiliza la estructura dúplex paralela. No se observó la unión de estos oligonucleótidos a sus secuencias de polipirimidina diana para formar el triplex paralelo G,T correspondiente. En cambio, cuando los dúplex de cadena paralela no modificados se mezclaron con su objetivo de polipirimidina, se formó un dúplex Watson-Crick entre cadenas. Tal y como predecían los cálculos teóricos, los dúplex de cadenas paralelas con 8-aminopurinas no se unieron a su diana. La preferencia por el dúplex paralelo frente al dúplex antiparalelo Watson-Crick se atribuye a la fuerte estabilización del dúplex paralelo producida por las 8-aminopurinas. Los estudios teóricos muestran que el isomorfismo de las tríadas es crucial para la estabilidad del triplex paralelo.

• Materias:Pliegue de Proteína Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Ácidos nucleicos Reparación del ADN Daño del ADN
• Subjects:Protein Folding Polymerase chain reaction Nucleic acids DNA Repair DNA Damage
• Palabras claves:dúplex, triplex paralelo, estructura dúplex paralela, secuencias objetivo de polipirimidina, adenina, aminoadenina, aminoguanina, aminopurinas, espectroscopias cd, dúplex de crick
• Keywords:duplexes, parallel triplex, parallel duplex structure, target polypyrimidine sequences, adenine, aminoadenine, aminoguanine, aminopurines, cd spectroscopies, crick duplex