Resumen

El cangrejo herradura, Limulus polyphemus, exhibe ritmos circadianos y circatidiales robustos, pero se sabe poco sobre los mecanismos moleculares subyacentes a esos ritmos. En este estudio, se recogieron cangrejos herradura durante el día y la noche, así como en mareas altas y bajas, y se procesaron sus tejidos musculares y del sistema nervioso central para secuenciar el genoma y el transcriptoma, respectivamente. El ensamblaje del genoma dio como resultado 7,4 × 10 5 contigs con un N50 de 4.736, mientras que el ensamblaje del transcriptoma dio como resultado 9,3 × 10 4 contigs y un N50 de 3.497. El análisis de la integridad funcional mediante la identificación de ortólogos universales putativos sugiere que el transcriptoma tiene tres veces más ortólogos esperados que el genoma. Curiosamente, el análisis RNA-Seq no indicó cambios estadísticamente significativos en el nivel de expresión de ningún gen circadiano central o accesorio, pero se produjo un ciclado significativo de varios transcritos no circadianos. En general, estos ensamblajes proporcionan un recurso para investigar los sistemas de reloj de Limulus y proporcionan un gran conjunto de datos para una mayor exploración de la taxonomía y la biología del cangrejo herradura del Atlántico.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:tejidos del sistema nervioso central, cangrejo herradura del Atlántico, sistemas de reloj de Limulus, ortólogos universales putativos, varios transcritos no circadianos, N50, contigs, genoma, Limulus polyphemus, análisis Seq
• Keywords:central nervous system tissues, Atlantic horseshoe crab, Limulus clock systems, putative universal orthologs, several noncircadian transcripts, N50, contigs, genome, Limulus polyphemus, Seq analysis