Resumen

La reconstrucción de redes de expresión génica utilizando datos de microarreglos es ampliamente estudiada con el objetivo de investigar el comportamiento de un grupo de genes de manera simultánea. Bajo la suposición gaussiana, la dependencia condicional entre genes en la red está completamente descrita por la matriz de coeficientes de correlación parcial. Debido a la alta dimensionalidad y dispersión, utilizamos el método LEP para estimarlo en este artículo. En comparación con los métodos existentes, el LEP alcanza el mayor PPV con la sensibilidad controlada a un nivel satisfactorio. Se analiza un conjunto de datos de expresión génica del proyecto HapMap para ilustración.

• Materias:Energías renovables Hidrocarburos Infección Enfermedades mentales Tumor
• Subjects:Renewable energy Hydrocarbons Infection Mental illness Tumor
• Palabras claves:Red de expresión génica; Datos de microarrays; Conglomerado génico; Matriz de coeficiente de correlación parcial; Método LEP; Proyecto HapMap
• Keywords:Gene expression network; Microarray data; Gene cluster; Partial correlation coefficient matrix; LEP method; HapMap project