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A Two-Stage Penalized Logistic Regression Approach to Case-Control Genome-Wide Association StudiesUn enfoque de regresión logística penalizada de dos etapas para estudios de asociación de genoma completo de casos y controles.

Resumen

Proponemos un enfoque de regresión logística penalizada de dos etapas para estudios de asociación de genoma a nivel mundial de tipo caso-control. Este enfoque consta de una etapa de screening y una etapa de selección. En la etapa de screening, las características de efecto principal e interacción se examinan utilizando verosimilitudes logísticas penalizadas. En la etapa de selección, las características retenidas se clasifican por la verosimilitud logística con la penalización de desviación absoluta suavemente recortada (SCAD) (Fan y Li, 2001) y la penalización de Prior de Jeffreys (Firth, 1993), se forman una secuencia de modelos candidatos anidados, y los modelos se evalúan mediante una familia de criterios de información bayesiana extendida (J. Chen y Z. Chen, 2008). El enfoque propuesto se aplica al análisis de los datos de cáncer de próstata del proyecto Marcadores Genéticos de Susceptibilidad al Cáncer (CGEMS) en el Instituto Nacional del C

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