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Robust Nonlinear Regression in Enzyme Kinetic Parameters EstimationRegresión no lineal robusta en la estimación de parámetros cinéticos enzimáticos

Resumen

La estimación precisa de parámetros cinéticos enzimáticos esenciales, como Km y Vmax, es muy importante en la biología moderna. Hasta la fecha, la linealización de ecuaciones cinéticas sigue siendo una práctica ampliamente establecida para determinar estos parámetros en la catálisis química y enzimática. Aunque la simplicidad de la optimización lineal es atractiva, estos métodos tienen ciertos escollos debido a los cuales la mayoría de las veces resultan en una estimación engañosa de los parámetros enzimáticos. Para obtener predicciones más precisas de los valores de los parámetros, se recomienda el uso de técnicas no lineales de ajuste por mínimos cuadrados. Sin embargo, cuando hay valores atípicos en los datos, estas técnicas dejan de ser fiables. En este trabajo se propone el uso de un estimador de regresión no lineal robusto basado en la función de biponderación de Tukey modificada que puede proporcionar resultados más resistentes en presencia de valores atípicos y/o observaciones influyentes. Se han utilizado datos cinéticos reales y sintéticos para probar nuestro enfoque. Se realizan simulaciones de Monte Carlo para ilustrar la eficacia y la robustez del estimador biweight en comparación con los métodos de linealización estándar y la regresión no lineal por mínimos cuadrados ordinarios. A continuación, aplicamos este método a datos experimentales de la enzima tirosinasa (EC 1.14.18.1) extraída de Solanum tuberosum, Agaricus bisporus y Pleurotus ostreatus. Los resultados, tanto en datos artificiales como experimentales, muestran claramente que el estimador robusto propuesto puede emplearse con éxito para determinar valores precisos de Km y Vmax.

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