Resumen

Introducción. Nuestro objetivo fue explorar la regulación a la baja del dominio en espiral 80 (CCDC80) y sus mecanismos moleculares subyacentes en el carcinoma de ovario (OVCA). Materiales y métodos. Se realizó una tinción inmunohistoquímica para confirmar el estado de expresión de la proteína CCDC80. Combinando los datos de microarrays de tejidos propios y conjuntos de datos de alto rendimiento, identificamos el nivel de expresión de CCDC80 en OVCA. Utilizamos el algoritmo de identificación de tipos celulares mediante la estimación de subconjuntos relativos de transcritos de ARN (CIBERSORT) y el análisis de enriquecimiento de conjuntos de genes de muestra única (ssGSEA) para explorar la relación entre CCDC80 y el panorama del microambiente tumoral (TME) en OVCA. El enriquecimiento de vías, la anotación de funciones y la exploración de factores de transcripción (FT) se llevaron a cabo para estudiar los mecanismos moleculares latentes. Además, se utilizaron los datos de líneas celulares de la base de datos Genomics of Drug Sensitivity in Cancer (GDSC) para descubrir la relación entre CCDC80 y la sensibilidad a los fármacos. Resultados. Una diferencia de medias estándar (DME) integrada de -0,919 (95 I: -1,515-0,324, P=0,002) identificó la regulación a la baja de CCDC80 en OVCA basándose en 1048 muestras, y el sROC (AUC=0,76) mostró una capacidad discriminatoria moderada de CCDC80 en OVCA. La fracción de células B ingenuas infiltrantes mostró diferencias significativas entre los grupos de alta y baja expresión de CCDC80. Además, los genes relacionados con CCDC80 están enriquecidos en la vía de señalización Ras y metabólica de lípidos. El receptor nuclear de la subfamilia tres grupo C miembro 1 (NR3C1) puede ser un TF aguas arriba de CCDC80, y CCDC80 puede estar relacionado con la sensibilidad de la mitocicina C y nilotinib. Conclusiones. CCDC80 fue regulado a la baja en OVCA y puede desempeñar un papel como supresor tumoral en OVCA.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genoma Genética vegetal Proteómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis genome Plant genetics Proteomics
• Palabras claves:CCDC80, OVCA, diferencia de medias estándar integrada, grupos de expresión de CCDC80, subfamilia de receptores nucleares, datos de líneas celulares, miembro del grupo C, micromatrices de tejidos domésticos, mecanismos moleculares latentes, capacidad discriminatoria moderada.
• Keywords:CCDC80, OVCA, integrated standard mean difference, CCDC80 expression groups, Nuclear receptor subfamily, cell line data, group C member, house tissue microarrays, latent molecular mechanisms, moderate discriminatory ability