Resumen

La escoba de bruja de la paulownia causada por la infección por fitoplasmas afecta a la producción de árboles de paulownia en todo el mundo. Cada vez hay más pruebas de que los ARN no codificantes largos (lncARN) desempeñan un papel protagonista en la regulación de la expresión de genes en las plantas. Hasta ahora, la identificación de lncRNAs se ha limitado a unas pocas especies de plantas modelo, y sus funciones en la mediación de las respuestas a Paulownia tomentosa libre de infección por fitoplasma aún no se han caracterizado. Aquí, se realizó la identificación de todo el genoma de lncRNAs, basado en la secuenciación de ARN de cadena específica, a partir de cuatro muestras de Paulownia tomentosa, y se identificaron 3689 lncRNAs. Estos lncRNAs mostraron una baja conservación entre especies vegetales y algunos de ellos eran precursores de miRNAs. Otros análisis revelaron que los 112 lncRNAs identificados estaban relacionados con la infección por fitoplasma. Predijimos los genes diana de estos lncRNAs sensibles al fitoplasma, y nuestro análisis mostró que 51 de los genes diana predichos estaban empalmados alternativamente. Además, encontramos que la expresión de los lncRNAs juega un papel vital en la regulación de los genes implicados en la respuesta hipersensible inducida por especies reactivas de oxígeno y la inmunidad desencadenada por efectores en Paulownia infectada por fitoplasma. Este estudio indicó que diversos conjuntos de lncRNAs fueron sensibles a la escoba de bruja Paulownia, y los resultados proporcionarán un punto de partida para comprender las funciones y mecanismos de regulación de Paulownia lncRNAs en el futuro.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Biogénesis Genética vegetal Genómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Biogenesis Plant genetics Genomics
• Palabras claves:lncRNAs, infección por fitoplasma, brujas de Paulownia, genes diana, pocas especies de plantas modelo, muestras de Paulownia tomentosa, especies reactivas de oxígeno, secuenciación específica de ARN, retama, expresión
• Keywords:lncRNAs, phytoplasma infection, Paulownia witches, target genes, few model plant species, Paulownia tomentosa samples, reactive oxygen species, specific RNA sequencing, broom, expression