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Repertoire of Protein Kinases Encoded in the Genome of Takifugu rubripesRepertorio de proteínas quinasas codificadas en el genoma de Takifugu rubripes

Resumen

Takifugu rubripes es un pez teleósteo ampliamente utilizado en genómica comparativa para comprender mejor el sistema humano debido a sus similitudes tanto en número de genes como en estructura de los mismos. En este trabajo estudiamos el genoma del fugu y, utilizando enfoques computacionales sensibles, identificamos el repertorio de proteínas quinasas putativas y las clasificamos en grupos y subfamilias. El genoma del fugu codifica 519 secuencias similares a proteínas quinasas y este número de proteínas quinasas putativas es comparable de cerca al del ser humano. Sin embargo, a pesar de sus similitudes con las quinasas humanas a nivel de grupo, existen diferencias a nivel de subfamilia, como se observa en el caso de las subfamilias KIS y DYRK, que contribuyen a diferencias que son específicas de la adaptación del organismo. Además, cierta combinación única de dominio de galectina y dominio YkA sugiere mecanismos alternativos para la respuesta inmunitaria y la unión a lipoproteínas. Por último, una similitud general con la vía MAPK de los humanos sugiere su importancia para comprender los mecanismos de señalización en humanos. En general, el fugu es un buen organismo modelo para comprender las funciones de las quinasas humanas en lo que respecta a quinasas como LRRK e IRAK y sus vías asociadas.

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