Se derivan las matrices operativas de integración de orden fraccional para las funciones de onda de Legendre y Chebyshev. Se emplean funciones de pulso en bloque y el método de colocación para derivar un procedimiento general para formar estas matrices tanto para las funciones de onda de Legendre como para las de Chebyshev. Luego se proponen métodos numéricos basados en la expansión de ondaleta y estas matrices operativas. En este método propuesto, mediante un cambio de variables, las ecuaciones diferenciales fraccionarias de multiorden (MOFDEs) con condiciones iniciales no homogéneas se transforman en MOFDEs con condiciones iniciales homogéneas para obtener una solución numérica adecuada de estos problemas. Se proporcionan ejemplos numéricos para demostrar la aplicabilidad y simplicidad del esquema numérico basado en las funciones de onda de Legendre y Chebyshev.
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