Resumen

Se pueden reformular las ecuaciones maestras químicas de la red de reacciones estocásticas en una ecuación diferencial parcial (PDE) de una función generadora de probabilidades (PGF). En este documento, presentamos dos mejoras en dicho enfoque PGF-PDE, basadas en perturbación y doble truncamiento, respectivamente. El sistema rígido que involucra reacciones rápidas y lentas juntas a menudo requiere un alto costo computacional. Al aplicar el método de perturbación a las PGF-PDE, expandimos la ecuación en términos de una tasa de reacción pequeña que a menudo es responsable de esa rigidez del sistema. También al truncar doblemente, eliminamos términos relativamente pequeños y reducimos significativamente la carga computacional en cada paso de tiempo. Los términos correspondientes a eventos raros se filtran a través de los truncamientos de la expansión de Taylor. Se muestra a través de ejemplos numéricos de cinética enzimática, modelo de transición y modelo de Brusselator que el método suger

• Materias:Algoritmo de búsqueda Características infrarrojas Retraso difuso Efecto de termoforesis Interpolación
• Subjects:Search algorithm Infrared features Fuzzy delay Thermophoresis effect Interpolation
• Palabras claves:Ecuaciones maestras químicas; Red de reacciones estocásticas; Ecuación diferencial parcial; Función generadora de probabilidad; Método de perturbación; Doble truncamiento.
• Keywords:Chemical master equations; Stochastic reaction network; Partial differential equation; Probability generating function; Perturbation method; Double-truncation.