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Intron Retention and TE Exonization Events in ZRANB2Retención de Intrones y Eventos de Exonización TE en ZRANB2

Resumen

El dedo de zinc, la proteína 2 que contiene el dominio de unión a RAN (ZRANB2), contiene dominios ricos en arginina/serina (RS) que median su función en la regulación del splicing alternativo. El gen ZRANB2 contiene 2 elementos LINE (L3b, Plat_L3) entre los exones 9º y 10º. Identificamos el evento de exonización de un elemento LINE (Plat_L3). Mediante PCR genómica, amplificación RT-PCR y secuenciación de muestras de ADN y ARN de primates, analizamos las características evolutivas de los transcritos de ZRANB2. Los resultados indicaron que 2 de los elementos LINE estaban integrados en humanos y en todas las muestras de primates analizadas (hominoideos: 3 especies; mono del Viejo Mundo: 8 especies; mono del Nuevo Mundo: 6 especies; prosimio: 1 especie). El ser humano, el mono rhesus, el mono cangrejero, el mono verde africano y el tití albergan el exón derivado del elemento LINE (Plat_L3). La amplificación RT-PCR reveló los transcritos largos y sus patrones de expresión diferencial. Curiosamente, estos transcritos largos se expresaron abundantemente en los linajes de monos del Viejo Mundo (monos rhesus, monos cangrejeros y monos verdes africanos) y se expresaron a través de la retención de intrones (IR). Así, el gen ZRANB2 produce 3 variantes de transcripción en las que el Cterminus varía por mecanismos de exonización e IR de elementos transponibles (TEs). Por lo tanto, ZRANB2 es valioso para investigar los mecanismos evolutivos de exonización TE y IR durante la evolución de los primates.

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