Resumen

La cepa E19T descrita como Hartmannibacter diazotrophicus gen. nov. sp. nov. fue aislada de la rizosfera de Plantago winteri de una pradera salina natural en una zona de protección de la naturaleza. La cepa E19T es una rizobacteria promotora del crecimiento vegetal capaz de colonizar la rizosfera de la cebada y de promover su crecimiento sólo en condiciones de estrés salino. Para conocer las bases genéticas de la promoción del crecimiento vegetal y su estilo de vida en la rizosfera bajo condiciones salinas, determinamos la secuencia completa del genoma utilizando dos plataformas de secuenciación complementarias (Ilumina MiSeq y PacBio RSII). El genoma E19T comprende un cromosoma circular y un plásmido que contiene varios genes implicados en la adaptación a la sal y genes relacionados con rasgos promotores del crecimiento de la planta bajo estrés salino. A partir de experimentos previos, se identificó la actividad ACC deaminasa como uno de los principales mecanismos de E19T para promover el crecimiento de las plantas bajo estrés salino. Curiosamente, no se ha descrito la presencia de ningún gen que codifique la actividad ACC deaminasa. En general, el genoma E19T proporciona información para confirmar, descubrir y comprender mejor muchos de sus rasgos previamente evaluados implicados en la promoción del crecimiento de las plantas bajo estrés salino. Además, la secuencia completa del genoma de E19T ayuda a definir su afiliación filogenética basada en el gen 16S rRNA, de la que no se había informado previamente. Hartmannibacter forma un subgrupo distinto con los géneros Methylobrevis, Pleomorphomonas, Oharaeibacter, y Mongoliimonas subagrupados con géneros pertenecientes a Rhizobiales.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:Actividad ACC deaminasa, genoma E19T, cepa E19T, fomento del crecimiento vegetal, estrés salino, rizosfera, crecimiento vegetal, secuencia completa del genoma E19T, gen 16S rRNA poco claro, Hartmannibacter diazotrophicus gen
• Keywords:ACC deaminase activity, E19T genome, Strain E19T, plant growth promotion, salt stress, rhizosphere, plant growth, complete E19T genome sequence, unclear 16S rRNA gene, Hartmannibacter diazotrophicus gen