Resumen

La batata, Ipomoea batatas (L.) Lam., es un importante cultivo alimentario en todo el mundo. El boniato de pulpa anaranjada se considera una fuente importante de betacaroteno. En este estudio, se determinaron los perfiles del transcriptoma de un cultivar de boniato de pulpa anaranjada "Weiduoli" y su mutante "HVB-3" con alto contenido en carotenoides utilizando la tecnología de secuenciación de alto rendimiento. Se produjeron un total de 13.767.387 y 9.837.090 lecturas de alta calidad de Weiduoli y HVB-3, respectivamente. Estas lecturas se ensamblaron de novo en 58.277 transcritos y 35.909 unigenes con una longitud media de 596 pb y 533 pb, respectivamente. En total, se obtuvieron 874 genes expresados diferencialmente (DEG) entre Weiduoli y HVB-3, 401 de los cuales estaban regulados al alza y 473 a la baja en HVB-3 en comparación con Weiduoli. De los 697 DEG anotados, 316 DEG tenían términos GO y 62 DEG se asignaron a 50 vías. Los 22 DEGs y 31 factores de transcripción implicados en la biosíntesis de carotenoides fueron identificados entre Weiduoli y HVB-3. Además, se detectaron 1.725 marcadores SSR. Este estudio proporciona los recursos genómicos para descubrir los genes implicados en la biosíntesis de carotenoides de la batata y otras plantas.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:DEGs, HVB-3, Weiduoli, biosíntesis de carotenoides, batata, alto contenido en carotenoides, importante cultivo alimentario, cultivar de batata, genes, naranja
• Keywords:DEGs, HVB-3, Weiduoli, carotenoid biosynthesis, sweet potato, high carotenoid content, important food crop, sweet potato cultivar, genes, orange