Resumen

La construcción y caracterización de un transcriptoma de trigo polaco es un paso crucial para estudiar rasgos útiles del trigo polaco. En este estudio, se ensambló un transcriptoma, incluyendo 76.014 unigenes, a partir de raíces, tallos y hojas de trigo polaco enano (DPW) utilizando el software Trinity. Entre estos unigenes, 61.748 (81,23%) fueron anotados funcionalmente en bases de datos públicas y clasificados en tipos diferencialmente funcionales. Alineando este transcriptoma con el borrador del genoma del trigo publicado por el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Trigo (IWGSC), 57.331 (75,42%) unigenes, incluyendo 26.122 unigenes AB-específicos y 2.622 unigenes D-específicos, se mapearon en los genomas A, B, y/o D. En comparación con el transcriptoma de T. turgidum, 56.343 unigenes coincidieron con 103.327 unigenes de T. turgidum. En comparación con los genomas del arroz y la cebada, 14.404 y 7.007 unigenes coincidieron con 14.608 genes de la cebada y 7.708 genes del arroz, respectivamente. Por otra parte, 2.148, 1.611 y 2.707 unigenes se expresaron específicamente en raíces, tallos y hojas, respectivamente. Por último, se observaron 5.531 secuencias SSR a partir de 4.531 unigenes, y se diseñaron 518 pares de cebadores.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:unigenes, transcriptoma, T. turgidum, Consorcio Internacional para la Secuenciación del Genoma del Trigo, borrador del genoma del trigo, trigo enano polaco, transcriptoma del trigo polaco, cebada, genes, arroz
• Keywords:unigenes, transcriptome, T. turgidum, International Wheat Genome Sequencing Consortium, draft wheat genome, dwarf polish wheat, polish wheat transcriptome, barley, genes, rice