Resumen

G. pentaphyllum (Gynostemma pentaphyllum), una planta herbácea perenne rastrera con muchas propiedades medicinales importantes, está ampliamente distribuida en Asia. Los gipenósidos (saponinas triterpenoides), principales componentes eficaces de G. pentaphyllum, están bien estudiados. La FPS (farnesil pirofosfato sintasa), la SS (escualeno sintasa) y la SE (escualeno epoxidasa) son las principales enzimas implicadas en la síntesis de las saponinas triterpenoides. Teniendo en cuenta las importantes funciones medicinales de G. pentaphyllum, es necesario investigar la información transcriptómica de G. pentaphyllum para facilitar futuros estudios de regulación transcripcional. Tras secuenciar G. pentaphyllum, obtuvimos 50.654.708 unigenes. A continuación, utilizamos RPKM (reads per kilobases per million reads) para calcular la expresión de los unigenes y realizamos la comparación de nuestros datos con los contenidos en cinco bases de datos comunes para anotar diferentes aspectos de los unigenes. Por último, observamos que FPS, SS y SE mostraban una expresión diferencial de enzimas en DESeq. Las hojas mostraron la mayor expresión de FPS, SS y SE en relación con los otros dos tejidos. Nuestra investigación proporciona información transcriptómica de G. pentaphyllum en su ambiente natural y encontramos consistencia en la expresión de unigenes, expresión de enzimas (FPS, SS, y SE), y la distribución del contenido de gypenosides en G. pentaphyllum. Nuestros resultados permitirán realizar futuros estudios relacionados con G. pentaphyllum.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:G. pentaphyllum, FPS, unigenes, información transcriptómica, saponinas triterpenoides, muchas propiedades medicinales importantes, farnesil pirofosfato sintasa, funciones medicinales importantes, principales componentes eficaces, Gynostemma pentaphyllum
• Keywords:G. pentaphyllum, FPS, unigenes, transcriptomic information, triterpenoid saponins, many important medicinal properties, farnesyl pyrophosphate synthase, important medicinal functions, main effective components, Gynostemma pentaphyllum