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Artículo

Selecting Negative Samples for PPI Prediction Using Hierarchical Clustering MethodologySelección de muestras negativas para la predicción de PPI utilizando la metodología de agrupamiento jerárquico.

Resumen

Las interacciones proteína-proteína (PPIs) desempeñan un papel crucial en los procesos celulares. En el presente trabajo, se propone un nuevo enfoque para construir un predictor de PPI entrenando un modelo de máquina de vectores de soporte a través de un algoritmo de selección de características paralelas de filtro-envoltura de información mutua y un agrupamiento iterativo y jerárquico para seleccionar un conjunto de entrenamiento negativo relevante. Mediante un conjunto de características seleccionadas subóptimas, el modelo de máquina de vectores de soporte construido es capaz de clasificar PPIs con alta precisión en cualquier conjunto de datos positivos y negativos.

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