La elevada tasa de enfermedades bacterianas en peces y gambas ha llevado a los científicos a buscar productos antibióticos naturales que actúen como solución. Un ejemplo de este producto son los productos metabólicos secundarios de las bacterias heterótrofas. Estas bacterias pueden encontrarse fácilmente en muchas regiones acuáticas y estuarios, incluido el distrito de Siak, en Riau (Indonesia). Por lo tanto, este estudio pretende determinar la capacidad de las bacterias aisladas para inhibir el crecimiento de patógenos (Vibrio alginolyticus, Aeromonas hydrophila y Pseudomonas sp.). La investigación se llevó a cabo de junio a septiembre de 2018. Actúa el tipo de bacterias heterótrofas en el área de muestreo utilizando la técnica de PCR. La estructura filogenética de los aislados bacterianos obtenidos durante este estudio se evaluó mediante la secuenciación de nucleótidos del gen 16S rRNA. La prueba de antagonismo demostró que las bacterias tenían capacidad para inhibir el crecimiento de patógenos (Vibrio alginolyticus, Aeromonas hydrophila y Pseudomonas sp.). Los resultados mostraron que se obtuvieron 25 aislados bacterianos puros, en 10 de los cuales se llevó a cabo la secuenciación del ADN, por lo que podrían utilizarse como antimicrobianos. A partir del análisis del ADNr 16S, se identificaron 10 aislados: 6 eran Bacillus cereus y 2 eran Pseudomonas aeruginosa con niveles de homología que oscilaban entre el 97 y el 99%, mientras que se sospechaba que las dos restantes eran nuevas especies de aislados. A partir del resultado, se pudo concluir que las bacterias heterótrofas se utilizan mejor como antipatógenos contra Vibrio alginolitycus que hydrophila y Pseudomonas sp.
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