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A Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation Using NAMD Package to Reveal Aggregation Profile of Phospholipids Self-Assembly in WaterSimulación dinámica molecular de grano grueso con el paquete NAMD para revelar el perfil de agregación del autoensamblaje de fosfolípidos en agua

Resumen

El perfil energético del proceso de autoensamblaje de DLPE, DLPS, DOPE, DOPS, DLiPE y DLiPS en agua se investigó mediante una simulación de dinámica molecular de grano grueso utilizando el paquete NAMD. El proceso de autoensamblaje se inició a partir de configuraciones aleatorias. La simulación se llevó a cabo durante 160 ns. Este estudio presentó pruebas de que había tres disposiciones principales autoensambladas que se hicieron visibles durante un cierto tiempo cuando tuvo lugar la simulación, es decir, liposoma, liposoma deformado y bicapa plana. El perfil energético que muestra una meseta en el momento en que emergen estas estructuras confirmó su estabilidad en las mismas. Nuestros resultados han puesto de relieve la idea de que los liposomas y los liposomas deformados son fases metaestables que con el tiempo se convertirán en bicapa plana, la estable.

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