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Limit-Cycle-Preserving Simulation of Gene Regulatory OscillatorsSimulación Preservadora de Ciclos Límite en Osciladores Regulatorios Genéticos

Resumen

Para simular de manera más efectiva osciladores de regulación génica, se adaptan integradores de Runge-Kutta (RK) a la estructura de ciclo límite del sistema. Teniendo en cuenta la naturaleza oscilatoria de los osciladores de regulación génica, se diseñan métodos de Runge-Kutta ajustados a la fase y a la amplificación (FRK). También se consideran nuevos métodos FRK con ajustes actualizados de fase y amplificación. Se obtienen los coeficientes de error y la constante de error para cada uno de los nuevos métodos FRK. En la simulación numérica del sistema de regulación génica de dos genes, se muestra que los nuevos métodos son más precisos y eficientes que sus métodos prototipo de RK en la integración a largo plazo. Es un nuevo descubrimiento que la mejor frecuencia de ajuste no solo depende del problema a resolver, sino también del método.

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