El patrón general de diversidad de la radiación de los anolis del Caribe se ha descrito con detalle; sin embargo, los mecanismos reales en el origen de su diversificación siguen siendo controvertidos. En particular, se debate el papel de la especiación ecológica y la importancia relativa de la divergencia en la alopatría y en la parapatría. Describimos la estructura genética de las poblaciones de anolis en zonas de contacto entre linajes y ecotonos para investigar el efecto de la divergencia alopátrica, la selección natural y la combinación de ambos factores en la diferenciación de las poblaciones. La divergencia alopátrica no tuvo un impacto significativo en la diferenciación a través del límite de linaje, mientras que se observó una clara bimodalidad en los caracteres genéticos y morfológicos a través de un ecotono dentro de un mismo linaje. Críticamente, la diferenciación más fuerte se observó cuando la alopatría y la ecología actúan conjuntamente, dando lugar a una fuerte reducción del flujo genético entre dos linajes que habitan hábitats diferentes. Sugerimos que, para que los anolis caribeños alcancen una especiación completa, puede ser necesaria una combinación sinérgica de varios factores históricos y ecológicos.
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