Resumen

Las moléculas de ARN plegadas han surgido recientemente como elementos reguladores críticos en las vías biológicas, sirviendo no sólo como portadoras de información genética sino también como componentes clave en los ensamblajes enzimáticos. En particular, el elemento de respuesta a la transactivación (TAR) del genoma del VIH regula la elongación transcripcional al interactuar específicamente con la proteína Tat, iniciando el reclutamiento del complejo de elongación. Impedir que se produzca esta interacción in vivo detiene la replicación del VIH, lo que convierte a las moléculas de unión al ARN en una interesante diana farmacéutica. Utilizando α-aminoácidos como materiales de partida, hemos diseñado y sintetizado una nueva clase de oligómeros poliamino-amido, denominados PAAs, específicamente para unirse a estructuras plegadas de ARN. Los monómeros PAA se incorporaron fácilmente a una biblioteca combinatoria de trimeros PAA de 125 miembros. Con el fin de evaluar rápidamente la unión del ARN, se desarrolló una pantalla fluorescente basada en puntos cuánticos para visualizar la unión del ARN a la resina. Las afinidades de unión de los resultados se cuantificaron mediante un ensayo de huella de terbio, lo que nos permitió identificar un ligando (SFF) con baja afinidad micromolar (kd=14 μM) por el ARN TAR. El trabajo aquí presentado representa el desarrollo de un andamiaje flexible que puede sintetizarse, analizarse y modificarse fácilmente para obtener ligandos específicos para la unión a ARN plegados.

• Materias:Genética molecular Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) Ácidos nucleicos
• Subjects:Molecular genetics Ribonucleic acid (RNA) Genomics Polymerase chain reaction Nucleic acids
• Palabras claves:elementos reguladores críticos, objetivo farmacéutico intrigante, baja afinidad micromolar, ensayo de huella de terbio, elemento de respuesta de transactivación, rna, genoma del vih, replicación del vih, monómeros paa, trímeros paa
• Keywords:critical regulatory elements, intriguing pharmaceutical target, low micromolar affinity, terbium footprinting assay, transactivation response element, rna, hiv genome, hiv replication, paa monomers, paa trimers