Resumen

El estudio del proteoma complejo plantea una mayor demanda para el método de cuantificación utilizando la tecnología de espectrometría de masas. En este documento, presentamos una herramienta de cuantificación sin etiquetas de espectrometría de masas para proteomas complejos, llamada freeQuant, que integra la cuantificación con el análisis funcional de manera efectiva. freeQuant consta de dos módulos bien integrados: cuantificación sin etiquetas y análisis funcional con conocimiento biomédico. freeQuant admite el análisis cuantitativo sin etiquetas que aprovecha al máximo el recuento espectral de espectrometría de masas en tándem (MS/MS), la longitud de la secuencia de proteínas, los péptidos compartidos y la intensidad iónica. Adopta el recuento espectral para el análisis cuantitativo y desarrolla un nuevo método para los péptidos compartidos para evaluar con precisión la abundancia de isoformas. Para las proteínas con baja abundancia, se incluye el recuento total de iones MS/MS junto con el recuento espectral para

• Materias:Internet de las cosas Inteligencia artificial Contaminantes atmosféricos Sistema biométrico Aplicaciones
• Subjects:Internet of things Artificial intelligence Air pollutants Biometric system Applications
• Palabras claves:Proteoma complejo; Tecnología de espectrometría de masas; Cuantificación sin etiquetas; FreeQuant; Análisis funcional; Recuento espectral
• Keywords:Complex proteome; Mass spectrometry technology; Label-free quantification; FreeQuant; Functional analysis; Spectral count