Resumen

Introducción. Los pequeños ARN no codificantes tienen importantes funciones reguladoras en diferentes vías celulares. Se cree que la mayoría de ellos intervienen principalmente en la regulación postranscripcional de los genes en el citoplasma. Recientes evidencias sugieren la actividad de miRNA y siRNA en el núcleo. Aquí mostramos distintos perfiles de distribución de localización subcelular de pequeños ARN no codificantes en todo el genoma en células de cáncer de mama humano. Métodos. Separamos los núcleos de las células de cáncer de mama del citoplasma e identificamos secuencias de ARN pequeños utilizando una plataforma de secuenciación de alto rendimiento. Para determinar la relación entre la distribución subcelular de miARN y la progresión del cáncer, utilizamos análisis de microarrays para examinar los niveles de expresión de miARN en el núcleo y el citoplasma de tres líneas celulares humanas, una línea celular de mama normal y dos líneas celulares de cáncer de mama. Para el análisis posterior se utilizaron regresión logística y SVM. Resultados. La distribución subcelular de los pequeños ARN no codificantes muestra que numerosos miARN y sus isoformas (isomiR) no sólo se localizan en el citoplasma, sino que también aparecen en el núcleo. Posteriores análisis de microarrays indicaron que la relación nuclear-citoplasmática de los miARN es una característica significativa de las diferentes líneas celulares cancerosas. Conclusiones. Nuestros resultados indican que la distribución subcelular es importante para la función de los miARN, y que la caracterización de la localización subcelular de los pequeños ARN puede contribuir a la investigación y el diagnóstico del cáncer.

• Materias:Genes mitocondriales Proliferación celular Receptor celular Autofagia Receptor de células
• Subjects:Mitochondrial genes Cell proliferation Cellular receiver Autophagy Cell receptor
• Palabras claves:distribución celular, citoplasma, ARN, núcleo, líneas celulares de cáncer de mama, núcleos celulares de cáncer de mama, perfiles de distribución de localización celular, diferentes líneas celulares de cáncer, células de cáncer de mama humano, línea celular de mama normal
• Keywords:cellular distribution, cytoplasm, RNAs, nucleus, breast cancer cell lines, breast cancer cell nuclei, cellular localization distribution profiles, different cancer cell lines, human breast cancer cells, normal breast cell line