Resumen

Las transposasas (Tnps) son enzimas que participan en el movimiento de secuencias de inserción (IS) dentro de los genomas y entre ellos. Los genes que codifican las Tnps se encuentran entre los más abundantes y ampliamente distribuidos en la naturaleza. Sin embargo, son difíciles de predecir bioinformáticamente y, dada la creciente disponibilidad de genomas procariotas y metagenomas, es necesario desarrollar una anotación automática rápida y de alta calidad de las ISs. Esta necesidad nos impulsó a desarrollar un servicio web, denominado TnpPred para el descubrimiento de Tnp. TnpPred proporciona una sensibilidad y especificidad para las predicciones de PNT mejores que las ofrecidas por los programas disponibles en la actualidad, según lo determinado por el análisis ROC. TnpPred debería ser útil para mejorar la anotación genómica. El servicio web TnpPred está disponible gratuitamente para uso no comercial.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genes mitocondriales Genómica Proteómica Epigenómica
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Mitochondrial genes Genomics Proteomics Epigenomics
• Palabras claves:Servicio web TnpPred, ISs, TnpPred, análisis ROC, descubrimiento Tnp, predicciones Tnp, anotación automática, programas disponibles, mejor sensibilidad, codificar Tnps
• Keywords:TnpPred web service, ISs, TnpPred, ROC analysis, Tnp discovery, Tnp predictions, automatic annotation, available programs, better sensitivity, encode Tnps