Resumen

En el ámbito del presente trabajo, se generaron cuatro bibliotecas de SuperSAGE, utilizando tejidos de raíces agrupados de cuatro accesiones tolerantes a la sequía en comparación con cuatro genotipos sensibles agrupados, con el objetivo de generar un panel de genes diferencialmente expresados en respuesta al estrés. Ambos grupos fueron sometidos a 24 horas de estrés por déficit hídrico. Las bibliotecas de SuperSAGE produjeron 8,787,315 etiquetas (26bp) que, después de excluir los singlets, permitieron la identificación de 205,975 unitags. Las coincidencias BlastN más relevantes comprendieron 567,420 etiquetas, correspondientes a 75,404 unitags con 164,860 ESTs diferentes. Para optimizar la eficiencia de la anotación, se llevó a cabo la categorización de Gene Ontology (GO) para 186,191 ESTs (BlastN contra Uniprot-SwissProt), lo que permitió la categorización de 118,208 ESTs (63.5%). En un intento de seleccionar un grupo de

• Materias:Energías renovables Hidrocarburos Infección Enfermedades mentales Tumor
• Subjects:Renewable energy Hydrocarbons Infection Mental illness Tumor
• Palabras claves:Bibliotecas de superSAGE; Accesiones tolerantes a la sequía; Genes responsivos al estrés; Estrés por déficit de agua; Categorización de la ontología génica; Estréses abióticos
• Keywords:SuperSAGE libraries; Drought-tolerant accessions; Stress-responsive genes; Water deficit stress; Gene ontology categorization; Abiotic stresses