Resumen

Se realizó un análisis del transcriptoma en dos cultivares populares de Lagerstroemia: "Natchez" (NAT), un híbrido interespecífico resistente al oídio y a las flores blancas, y "Carolina Beauty" (CAB), un cultivar de L. indica susceptible al oídio y a las flores rojas. Las lecturas de ARN-seq se generaron a partir de hojas infectadas por Erysiphe australiana y se ensamblaron de novo. Se identificó un total de 37.035 unigenes de 224.443 contigs ensamblados en ambos genotipos. Aproximadamente el 85% de estos unigenes tienen función conocida. De ellos, se encontraron 475 genes KEGG significativamente diferentes entre los dos genotipos. Cinco de los diez genes con mayor expresión diferencial (DEGs) están implicados en la biosíntesis de metabolitos secundarios (defensa de la planta) y cuatro en la vía de biosíntesis de flavonoides (actividades antioxidantes o coloración de la flor). Además, 5 de los 12 unigenes ensamblados en la biosíntesis de benzoxazinoides y 7 de 11 en la biosíntesis de flavonoides mostraron una mayor abundancia de transcritos en NAT. La abundancia relativa de transcritos para 16 DEGs candidatos (9 de CAB y 7 de NAT) detectados por qRT-PCR mostró un acuerdo general con las abundancias de los transcritos ensamblados en NAT. Este estudio proporciona los primeros análisis del transcriptoma en L. indica. La abundancia diferencial de transcritos entre dos genotipos indica que es posible identificar genes candidatos asociados a las defensas de la planta o a la coloración de las flores.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genética vegetal Genómica Proteómica Transcripción genética
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Plant genetics Genomics Proteomics Genetic transcription
• Palabras claves:NAT, genotipos, unigéneros, coloración de las flores, híbrido interespecífico resistente al mildiu, abundancia diferencial de transcritos, primeros análisis del transcriptoma, vía de la biosíntesis de flavonoides, mayor abundancia de transcritos, cultivares populares de Lagerstroemia.
• Keywords:NAT, genotypes, unigenes, flower coloration, mildew resistant interspecific hybrid, differential transcript abundance, first transcriptome analyses, flavonoid biosynthesis pathway, higher transcript abundance, popular Lagerstroemia cultivars