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Configuration Transitions of Free Circular DNA System Induced by NicksTransiciones de configuración del sistema de ADN circular libre inducidas por mellas

Resumen

Los nicks tienen funciones importantes en las funciones biológicas de los sistemas mediados por ADN. Sin embargo, las transiciones de configuración de las moléculas de ADN inducidas por la presencia de nicks no se han investigado cuantitativamente. Este estudio pretende analizar las transiciones de configuración del sistema de ADN circular libre inducidas por nicks. Utilizando microscopía de fuerza atómica, se observaron dos estados de configuración en el sistema de ADN circular libre con diferentes números de muescas. Para comprender la transmisión de energía torsional entre pares de bases de ADN, definimos la longitud efectiva y el ángulo de mellado. En el sistema de ADN libre, una energía de torsión de 233 pb puede liberarse completamente mediante nicks. Basándonos en los resultados experimentales y cuantitativos, proponemos un mecanismo físico para explicar las transiciones de configuración del sistema de ADN circular libre inducidas por nicks. Este estudio y el método presentado son muy útiles para comprender el mecanismo físico de los nicks en sistemas mediados por ADN.

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