Resumen

La fresa suele estar sometida a estrés por frío en regiones templadas cuando no se aplican estrictamente medidas de aislamiento en cultivos protegidos. El estrés por frío influye negativamente en el crecimiento y desarrollo de la planta al desencadenar un cambio masivo en el transcriptoma. Para proporcionar las estrategias potenciales en la mejora de la tolerancia al frío de la fresa y dar una idea de la comprensión de las complejas vías de señalización de frío en las plantas, este estudio identificó genes candidatos atractivos y reveló diversas redes de regulación que respondieron al estrés por frío en la fresa (Fragaria×ananassa) por un análisis transcriptómico. En total, hubo 2397 genes expresados diferencialmente (DEGs) bajo el tratamiento de estrés por frío (T1) frente al tratamiento normal (CK). De estos, 1180 DEGs fueron regulados al alza, mientras que 1217 DEGs fueron regulados a la baja. El análisis de enriquecimiento funcional mostró que los DEG estaban significativamente sobrerrepresentados (valor P ajustado < 0,05) en seis vías, incluyendo la transducción de señales de hormonas vegetales, la biosíntesis de flavonoides, la señalización de la proteína quinasa activada por mitógenos (MAPK), el metabolismo del almidón y la sacarosa, el ritmo circadiano y el metabolismo del ácido alfa-linolénico. La señalización del frío inició la expresión de genes de respuesta al frío (COR) con el elemento cis ABRE o CRT/DRE en la vía independiente o dependiente de ABA para impulsar la defensa de la planta contra el estrés. Llamativamente, GIGANTEA (gen id 101308922), PRR95 (gen id 101295449), y ERF105 (gen id 101295082) fueron dramáticamente inducidos bajo tratamiento de baja temperatura, indicando que jugaron un papel importante en la respuesta al estrés por frío en fresa.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:identificación de genes, estrés por frío, DEGs, fresa, transducción de señales de hormonas vegetales, factor de transcripción de respuesta ERF105, análisis de enriquecimiento funcional, genes candidatos atractivos, tratamiento de estrés por frío, regulador de respuesta a componentes
• Keywords:gene id, cold stress, DEGs, strawberry, plant hormone signal transduction, responsive transcription factor ERF105, Functional enrichment analysis, attractive candidate genes, cold stress treatment, component response regulator