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A Structural Approach to Disentangle the Visualization of Bipartite Biological NetworksUn Enfoque Estructural para Desentrañar la Visualización de Redes Biológicas Bipartitas

Resumen

Las interacciones entre dos gremios diferentes de entidades son omnipresentes en biología. Pueden ocurrir a nivel molecular, como en un diseasoma, o entre individuos vinculados por relaciones bióticas, como mutualismo o parasitismo. Estos conjuntos de interacciones son redes bipartitas complejas. La visualización es una herramienta poderosa para explorar y analizarlas, pero los gráficos más comunes, el grafo bipartito y la matriz de interacción, se vuelven bastante confusos al trabajar con redes biológicas reales. Hemos desarrollado dos nuevos tipos de visualización que explotan las propiedades estructurales de estas redes para mejorar la legibilidad. Una técnica llamada identifica grupos de nodos que comparten propiedades de conectividad. Con los resultados de este análisis, es posible construir un gráfico basado en la reducción de información (gráfico polar) y otro que toma los grupos como bloques elementales para la distribución espacial (gráfico de zigurat). Describimos las aplicaciones de ambos gráficos y el software para crearlos.

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