Resumen

Los microARN (miARN) son una clase de pequeños ARN no codificantes evolutivamente conservados, de ~22 nt de longitud, que se encuentran en diversos organismos y desempeñan importantes funciones en la regulación de la traducción y degradación de los ARNm. Se ha demostrado que los miARN intervienen en muchos procesos biológicos clave regulando la expresión de sus dianas. Los polimorfismos genéticos en los sitios diana de los miARN pueden alterar la regulación de los miARN y, por tanto, dar lugar a alteraciones de las dianas farmacológicas. Estudios recientes han demostrado que los SNP en los sitios diana de miARN pueden afectar a la eficacia de los fármacos. Sin embargo, aún queda por descubrir un gran número de variantes genéticas específicas relacionadas con la eficacia de los fármacos. Hemos integrado a gran escala variaciones genéticas, dianas de fármacos, redes de interacción génica, vías biológicas y regiones semilla de miARN para identificar polimorfismos de miARN que afectan a la respuesta a fármacos. Además, aprovechando las abundantes redes/vías biológicas de alta calidad, evaluamos la distribución en cascada de los impactos de tarSNP. Demostramos que las predicciones pueden descubrir la mayoría de los casos conocidos con apoyo experimental, así como proporcionar candidatos informativos complementarios a los métodos/herramientas existentes. Aunque existen varias bases de datos que predicen la ganancia o pérdida de la función diana de miARN mediada por SNPs, como PolymiRTS, miRNASNP, MicroSNiPer y MirSNP, ninguna de ellas evaluó las influencias de tarSNPs en las alteraciones de la respuesta a fármacos. Hemos desarrollado una base de datos en línea fácil de usar de este enfoque llamado Mir2Drug.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:sitios diana de miARN, eficacia de fármacos, dianas de fármacos, muchos procesos biológicos clave, abundante alta calidad, alteraciones de la respuesta a fármacos, base de datos en línea amigable, redes de interacción de genes, pequeños ARN no codificantes, variantes genéticas específicas.
• Keywords:miRNA target sites, drug efficiency, drug targets, many key biological processes, abundant high quality, drug response alterations, friendly online database, gene interaction networks, small noncoding RNAs, specific genetic variants