Resumen

En el presente informe, hemos estudiado los posibles inhibidores de COVID-19 a partir de componentes bioactivos de Centaurea jacea mediante un triple enfoque consistente en técnicas de química cuántica, acoplamiento molecular y dinámica molecular. La Centaurea jacea es una hierba perenne utilizada a menudo en la medicina popular para las afecciones dermatológicas y la fiebre. Además, también se han descrito las propiedades anticancerígenas, antioxidantes, antibacterianas y antivirales de sus compuestos bioactivos. La Mpro (proteasas principales) se acopló con diferentes compuestos de Centaurea jacea mediante acoplamiento molecular. Todos los compuestos estudiados, incluyendo apigenina, axilarina, centaureidina, cirsiliol, eupatorina e isokaempferida, muestran afinidades de unión adecuadas al sitio de unión de la proteasa principal del SARS-CoV-2 con sus energías de unión de -6,7 kcal/mol, -7,4 kcal/mol, -7,0 kcal/mol, -5,8 kcal/mol, -6,2 kcal/mol y -6,8 kcal/mol, respectivamente. Entre todos los compuestos estudiados, la axilarina resultó tener la máxima eficacia inhibidora, seguida de la centaureidina, la isokaempferida, la apigenina, la eupatorina y el cirsiliol. Nuestros resultados sugieren que la axilarina se une con los residuos catalíticos más cruciales CYS145 y HIS41 de la Mpro, además la axilarina muestra 5 interacciones de enlace de hidrógeno y 5 interacciones hidrofóbicas con varios residuos de la Mpro. Por otra parte, los cálculos de dinámica molecular en una escala de tiempo de 60 ns (6×106 femtosegundos) también mostraron conocimientos significativos sobre los efectos de unión de la axilarina con la Mpro del SARS-CoV-2 imitando un entorno acuoso similar al de las proteínas. A partir de cálculos de dinámica molecular, los cálculos RMSD y RMSF indican la estabilidad y la dinámica del mejor complejo acoplado en medio acuoso. Las propiedades ADME y el análisis de predicción de toxicidad de la axilarina también la recomiendan como fármaco candidato seguro. Además, las investigaciones in vivo e in vitro son esenciales para garantizar la actividad anti SARS-CoV-2 de todos los compuestos bioactivos, en particular axillarin, para fomentar el uso preventivo de Centaurea jacea contra las infecciones COVID-19.

• Materias:Acetamida
• Subjects:Acetamida
• Palabras claves:COVID-19; Apigenina; Centaurea jacea; Química cuántica; Acoplamiento molecular; Dinámica molecular
• Keywords:COVID-19; Apigenin; Centaurea jacea; Quantum chemistry; Molecular docking; Molecular dynamics