Resumen

El gen SUPT16H conocido como FACTP140 es necesario para la transcripción de otros genes. Para la transcripción, los genes necesitan formar complejos con factores accesorios, incluidos los factores de transcripción y la ARN polimerasa II. Uno de estos factores, el FACT, interactúa con las histonas H2A/H2B para el desmontaje del nucleosoma y la elongación de la transcripción. El gen SUPT16H tiene una transcripción y muchas etiquetas de secuencia expresada (EST). Nos interesaba especialmente un transcrito derivado de MaLR (EST, BX333035) que incluía un nuevo exón introducido por un elemento transponible, un retrotransposón LTR aparente de mamífero (MaLR). El MaLR se detectó desde humanos hasta galagos, lo que indica que el MaLR en el gen SUPT16H está integrado en el genoma ancestro de los primates. Se creó un nuevo exón mediante un sitio donante alternativo proporcionado por el MaLR. La transcripción original y la transcripción derivada del MaLR se expresaron en varios tejidos humanos, de mono rhesus y de otros primates. Además, identificamos un nuevo transcrito alternativo que incluía el MaLR, pero no hubo diferencias significativas en la expresión del transcrito original y del transcrito derivado del MaLR. Curiosamente, el nuevo transcrito alternativo y el transcrito derivado de MaLR tenían la secuencia MaLR en el nuevo exón, pero tenían estructuras diferentes al adoptar diferentes sitios de empalme 3′. A partir de este estudio, verificamos elementos transponibles que contribuyeron a la diversidad del transcriptoma.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Genómica Polimorfismo genético Proteómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Genomics Genetic polymorphism Proteomics Computational biology
• Palabras claves:MaLR, transcripción, nueva transcripción alternativa, gen SUPT16H, nuevo exón, transcripción original, retrotransposón LTR aparente de mamíferos, ARN polimerasa II, sitio donante alternativo, otros tejidos de primates.
• Keywords:MaLR, transcript, new alternative transcript, SUPT16H gene, new exon, original transcript, mammalian apparent LTR retrotransposon, RNA polymerase II, alternative donor site, other primate tissues