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A New Biomedical Passage Retrieval Framework for Laboratory Medicine: Leveraging Domain-specific Ontology, Multilevel PRF, and Negation Differential WeightingUn nuevo marco de recuperación de pasajes biomédicos para medicina de laboratorio: Aprovechamiento de la ontología específica del dominio, PRF multinivel y ponderación diferencial de la negación

Resumen

La búsqueda de apoyo a la toma de decisiones clínicas (CDS) se realiza para recuperar bibliografía médica clave que pueda ayudar a la práctica de los expertos médicos ofreciendo información médica adecuada y relevante para el caso médico en cuestión. En este artículo, presentamos un novedoso marco de búsqueda CDS diseñado para la recuperación de pasajes de libros de texto biomédicos con el fin de apoyar la toma de decisiones clínicas utilizando los resultados de pruebas de laboratorio. El marco utiliza dos características únicas de los informes textuales derivados de los resultados de las pruebas, que son la variación sintáctica y la información de negación. El marco propuesto consta de tres componentes: ontología de dominio, repositorio de índices y motor de procesamiento de consultas. En primer lugar, creamos una ontología de dominio para resolver la variación sintáctica aplicando la ontología para detectar conceptos médicos a partir de los resultados de las pruebas con traducción lingüística. A continuación, preprocesamos y realizamos la indexación de los libros de texto biomédicos recomendados por los médicos para la recuperación de pasajes. Por último, construimos el motor de procesamiento de consultas adaptado a CDS, que incluye traducción, detección de conceptos, expansión de consultas, retroalimentación de pseudorrelevancia a nivel local y global, y clasificación con ponderación diferencial de la información de negación. Para evaluar la eficacia del marco propuesto, seguimos el procedimiento estándar de evaluación de la recuperación de información. Se creó un conjunto de datos de evaluación que incluía 28.581 informes textuales de 30 resultados de pruebas de laboratorio y 56.228 pasajes de libros de texto biomédicos ampliamente utilizados y recomendados por médicos. En general, nuestro marco de recuperación de pasajes propuesto, GPRF-NEG, supera a la línea de base en un 36,2, 100,5 y 69,7 por ciento para MRR, R-precisión y Precisión a 5, respectivamente. Los resultados de nuestro estudio indican que el marco de búsqueda CDS propuesto, diseñado específicamente para la recuperación de pasajes de literatura biomédica, representa una opción viable en la práctica para los médicos, ya que apoya sus procesos de toma de decisiones proporcionando pasajes relevantes extraídos de las fuentes que prefieren consultar, con mejores rendimientos.

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