Resumen

Boehmeria tricuspis (Hance) Makino es una planta herbácea o arbustiva perenne resistente originaria de Asia oriental que presenta distintos niveles de ploidía y modos de reproducción (de diplósporo a sexual). Aunque se han descrito varios genes asociados a la apomeiosis, el control genético y los mecanismos moleculares subyacentes siguen siendo poco conocidos. Además, aún no se ha aclarado la base de la correlación entre poliploidía y apomixis. Hemos utilizado secuenciación de lectura larga para producir un transcriptoma floral de referencia completo de B. tricuspis. A partir de la base de datos generada, se comparó la expresión génica de las flores femeninas de diferentes niveles de ploidía y citotipos de modo reproductivo. En total, se identificaron 1.387 genes relacionados con la apomeiosis, 217 genes relacionados con la ploidía y 9 genes asociados tanto con la apomixis como con la ploidía. Los análisis de ontología génica de este conjunto de transcritos indicaron que los genes reproductivos, especialmente los relacionados con la "diferenciación celular" y el "proceso del ciclo celular", son factores significativos que regulan la apomeiosis. Además, nuestros resultados sugirieron que diferentes expresiones de genes de respuesta al estrés podrían ser importantes en la preparación para la transición a la apomeiosis. Además, nuestras observaciones indicaron que la expresión de la apomeiosis podría no depender de la poliploidía, sino más bien de la desregulación de la vía sexual en B. tricuspis.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genética vegetal Genómica Biología computacional
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Plant genetics Genomics Computational biology
• Palabras claves:diferentes niveles de ploidía, apomeiosis, genes, B. tricuspis, análisis de Gene Ontology, proceso del ciclo celular, citotipos de modo reproductivo, arbusto perenne nativo, genes de respuesta al estrés, ploidía
• Keywords:different ploidy levels, apomeiosis, genes, B. tricuspis, Gene Ontology analyses, cell cycle process, reproductive mode cytotypes, shrubby perennial native, stress response genes, ploidy