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A Toolbox for Predicting G-Quadruplex Formation and StabilityUna caja de herramientas para predecir la formación y estabilidad de cuádruplex G

Resumen

Los cuadruplex G son estructuras de ácido nucleico de cuatro hebras formadas alrededor de un núcleo de guaninas, dispuestas en cuadrados con enlaces de hidrógeno mutuos. Muchas de estas estructuras son muy estables térmicamente, sobre todo en presencia de cationes monovalentes, como los que se encuentran en condiciones fisiológicas. El conocimiento de sus funciones fisiológicas se está ampliando rápidamente, y se las ha implicado en la regulación de la transcripción y la traducción de genes, entre otras funciones. Hemos creado un sitio web orientado a la comunidad para que sirva de repositorio de la información que se está desarrollando en la actualidad. El núcleo de este sitio es una base de datos detallada (QuadDB) de cuadruplexos G predichos en el genoma humano y otros genomas, junto con el algoritmo de predicción utilizado para identificarlos. También ofrecemos un servidor QuadPredict, que predice la estabilidad térmica y actúa como repositorio de datos experimentales de todos los investigadores. También existen otras fuentes de datos con predicciones computacionales. Prevemos que la amplia disponibilidad de esta información será de utilidad tanto para los investigadores ya activos en este apasionante campo como para quienes deseen investigar una hipótesis genética concreta.

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