Resumen

Objetivos. Este estudio tiene como objetivo identificar una firma pronóstica para el cáncer de cuello uterino. Métodos principales. Los datos de expresión génica y la información clínica del cáncer de cuello de útero y los tejidos cervicales normales se obtuvieron de The Cancer Genome Atlas y de tres conjuntos de datos de la base de datos Gene Expression Omnibus. Se emplearon DESeq2 y Limma para analizar los genes expresados diferencialmente (DEG). Los DEG solapados entre todos los conjuntos de datos se consideraron los DEG finales. A continuación, se realizó el análisis de enriquecimiento funcional. Además, se realizó la regresión de riesgos proporcionales de Cox para establecer una firma pronóstica de los DEG. Se aplicó el análisis de Kaplan-Meier para probar el modelo. Las relaciones entre la expresión génica y los parámetros clinicopatológicos del cáncer de cuello uterino, incluidos la edad, el estado del VPH, la histología, el estadio y la metástasis en los ganglios linfáticos, se analizaron mediante la prueba de chi-cuadrado. Las mutaciones somáticas de estos genes pronósticos se evaluaron mediante cBioPortal. La solidez del modelo se verificó en otras dos cohortes de validación independientes. Hallazgos clave. En total, se identificaron 169 genes regulados al alza superpuestos y 29 genes regulados a la baja superpuestos en el cáncer de cuello uterino en comparación con los tejidos cervicales normales. El análisis de enriquecimiento funcional indicó que los DEG estaban principalmente enriquecidos en la replicación del ADN, el ciclo celular y la vía de señalización de p53. Por último, se construyó una firma pronóstica basada en 5 genes (ITM2A, DSG2, SPP1, EFNA1 y MMP1). Según este modelo, se asignó a cada paciente un valor de riesgo relacionado con el pronóstico. El análisis de Kaplan-Meier mostró que un mayor riesgo estaba relacionado con una peor supervivencia global en el cáncer de cuello uterino, con un área bajo la curva receiver operating characteristic de 0,811 para 15 años. La validez de este modelo en la predicción del resultado del cáncer de cuello uterino se verificó en otros dos conjuntos de datos independientes. Además, nuestro estudio también descubrió que la baja expresión de ITM2A se asociaba con el adenocarcinoma cervical. Curiosamente, DSG2 se asoció con el estado del VPH en el cáncer de cuello uterino. Importancia. Nuestro estudio construyó un modelo de pronóstico en cáncer cervical y descubrió dos nuevos genes, ITM2A y DSG2, asociados con la carcinogénesis cervical y la supervivencia.

• Materias:Ácido ribonucleico (ARN) Biosíntesis Genómica Inestabilidad genómica Polimorfismo genético
• Subjects:Ribonucleic acid (RNA) Biosynthesis Genomics Genomic instability Genetic polymorphism
• Palabras claves:cáncer cervical, tejidos cervicales normales, firma pronóstica, DEGs, modelo, DSG2, ITM2A, estudio, estado del VPH, análisis de Meier
• Keywords:cervical cancer, normal cervical tissues, prognostic signature, DEGs, model, DSG2, ITM2A, study, HPV status, Meier analysis