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A New Implementation of Genome Rearrangement ProblemUna nueva aplicación del problema de reordenación del genoma

Resumen

El reordenamiento inverso del genoma sin signo es una parte importante de la investigación bioinformática, que se utiliza ampliamente en el análisis de similitudes y homologías biológicas, revelando la herencia biológica, la variación y la evolución. Los algoritmos "Branch and bound", "simulated annealing" y otros algoritmos de reordenación inversa del genoma sin signo son poco comunes en la aplicación práctica debido a su enorme consumo de tiempo y espacio, y en la actualidad se utilizan sobre todo algoritmos codiciosos. Analizando en profundidad el dominio del algoritmo de reordenación inversa del genoma sin firmar basado en la estrategia codiciosa (algoritmo de reordenación inversa del genoma sin firmar (URGRA) basado en la estrategia codiciosa), se modelan las características del dominio y se diseñan interactivamente los componentes del algoritmo URGRA de acuerdo con el método de programación de producción. Con el apoyo de la plataforma PAR, la biblioteca de componentes del algoritmo URGRA se realiza formalmente, y el algoritmo concreto se genera por ensamblaje, lo que mejora la fiabilidad del algoritmo de ensamblaje.

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